中医药学院为学校新兴学院，专注于培养高素质技术技能型中医药人才，现开设中医学、中药学和针灸推拿三个专业。中医学专业开办于1958年，复办于2020年，已连续招生4届；中药学专业开办于2010年，已连续招生14届，并与南京中医药大学连续四年合作开设“3+2”班，与江苏省中医院连续四年合作开设“中药特色技术传承班”，与苏州雷允上国药连锁连续四年合作开设“储备店长班”；针灸推拿专业开办于2024年，今年为首次招生。根据中国科教评价网2024年“中国高职院校专业竞争力排行榜”，中药学专业排名全国第5（194所），江苏第1，中医学类专业排名全国第14（302所），江苏第1，在全省乃至全国继续保持领先优势和竞争力。
学院现有专任专业教师36人，其中博士22名，副高职称以上教师14名，全国中医药职业教育教学指导委员会委员1名，省“333高层次人才”1人，省高校“青蓝工程”优秀教学团队1个及中青年学术带头人和优秀青年骨干教师各2人，省老中医药专家学术经验继承人1人，省科技智库青年人才1人，省产业教授3人。并拥有5家临床教学医院和20余家优质见习、实习基地。
学院以“崇德尚能，国粹育人”为理念，以“承岐黄薪火，传中医国粹，铸实践体系，育‘三能’人才”为目标，以“笃行致远，实干兴院”为践行标准，深耕细作，锐意进取，师生一心，共创美好明天。（截止2024年9月）